NaClO溶液的滅菌原理是通過水解形成的次氯酸，次氯酸再進一步分解就形成了新生態的氧，新生態氧的極強氧化性使得菌體與病毒的蛋白質發生變性，從而使病源微生物發生致死。消毒的原理是以產生出次氯酸的方式實現的。次同氨可以發生反應，在水中生成微量的氯氨化合物，但這種物質是比較安全的殺生藥劑，遠不及NaClO的實際殺菌能力。
浸泡法。將待消毒的物品放入裝有含氯消毒劑溶液的容器中，加蓋。對細菌繁殖體污染的物品的消毒，用含有效氯 500mg/L 的消毒液浸泡 10min 以上；對經血傳播病原體、分枝和細菌芽孢污染物品的消毒，用含有效氯 2000 mg/L～5000mg/L 消毒液浸泡 30min 以上。
② 擦拭法。對大件物品或其它不能用浸泡法消毒的物品用擦拭法消毒。 消毒所有濃度和作用時間參見浸泡法。
③ 噴灑法。對一般污染的物品表面，用1000mg/L的消毒液均勻噴灑，作用 30min 以上；對經血傳播病原體、等污染表面的消毒，用含有效氯 2000mg/L 的消毒液均勻噴灑，作用 60min 以上。噴灑后有強烈的刺激性氣味，人員應離開現場。
④ 干粉消毒法。對排泄物的消毒，用含氯消毒劑干粉加入排泄物中，使含有效氯10000mg/L，略加攪拌后，作用 2h～6h，對醫院污水的消毒，用干粉按有效氯 50mg/L 用量加入污水中，并攪拌均勻，作用 2h后排放。
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